Toto velkolepé drama vychází z výpovědí očitých svědků, aktuálních rozhovorů a poznatků moderní vědy, aby vyprávělo skutečný příběh o jedné z nejhorších přírodních katasrof v historii. Dne 26. srpna 1883 na malém sopečném ostrově vybuchl vulkán, který rozpoutal sérii děsivých tsunami, explozí a žhavých oblaků popela. Během 48 hodin zničil stovky měst a vesnic a zanechal za sebou více než 36 tisíc mrtvých.

Film zobrazuje čtyři příběhy, které se navzájem prolínají: Příběh holanského dispečera Willema Beijerincka a jeho manželky Johany snažící se zachránit svoji rodinu;  vědce Rogiera Verbeeka, který si až příliš pozdě uvědomí rozsah katastrofy a důsledky jeho selhání při varování populace; strážce majáku Jacoba Schuita odmítajícího opustit svůj post, i když je pobřeží už zaplaveno popelem; a hrdiny lodního kapitána Lindemana zodpovědného za životy lodních cestujících, se kterými uvízl na moři.

Živá rekonstukce jevu, který je mnohými považován za první  globální mediální událost. Krakatoa: Sopka zkázy je autentická rekonstrukce toho, co se událo během erupce a detailně popisuje  devastující následky výbuchu